Обработка результатов анализа

Визуализацию гибридизационной картины на биологическом микрочипе для анализируемой пробы осуществляют с помощью аппаратно-программного комплекса для анализа биологических микрочипов "EuroBioWto Биоконтроль" и компьютерной программы "MedGen". Полученную на экране компьютера гибридизационную картину для анализируемой пробы сравнивают с гибридизационной картиной для положительного контроля (заведомо трансгенной ДНК) и гибридизационной картиной для отрицательного контроля (заведомо нетрансгенной ДНК). Пример схемы гибридизационной картины биологического микрочипа приведен на рис.9.

Рис. 9 Пример схемы биологического микрочипа для идентификации генетически модифицированных источников растительного происхождяения.PC‑положительный контроль , NC‑отрицательный контроль, Lect-ген белка сои , Zein-ген белка кукурузы, Gus, Nos, 35s, Npt, Ocs-трансгенные последовательности

Наличие яркого специфического окрашивания биологического микрочипа в местах, содержащих иммобилизационные олигонуклеотиды (для промоторов 35S и Nos, терминатора Ocs, генов Gus или NptII) , свидетельствует о присутствии конкретных чужеродных последовательностей ДНК в анализируемой пробе, т. е. о трансгенности анализируемой ДНК. Отсутствие окраски после анализа указывает на отсутствие конкретных чужеродных последовательностей ДНК в анализируемой пробе, т. е. о нетрансгенности анализируемой ДНК. Наличие окрашивания NC cвидетельствует о получении ложноположительного результата. Причиной может быть загрязнение ГМИ реактивов и/или оборудования. В этом случае необходимо обработать поверхности лабораторных столов и оборудования раствором соляной кислоты (1 моль/дм3), заменить реактивы на свежеприготовленные и повторить анализ.

Анализ с использованием биочипов находит в настоящее время широкое применение на практике. Он отличается высокой чувствительностью, простотой процедуры выполнения, возможностью одновременного анализа множества параметров, специфичностью и воспроизводимостью. Применение биологических микрочипов может быть очень эффективно в таких сферах деятельности, как : обнаружение контаминации в продуктах питания и окружающей среде, диагностика и прогнозирование заболеваний, обнаружение элементов биологического оружия, оценка лекарственной эффективности. Разработка биочиповых технологий в РФ является одной из тех высоко-технологичных областей, которой уделяется особое внимание.

Популярные статьи:

Результаты и обсуждение
Выращивание штамма на 2Н2О-содержащих средах . Для выращивания штамма был выбран ступенчато-увеличивающийся градиент концентрации 2H2О в ростовых средах в присутствии 2 об.% [U -2H] MetOH, так как предпологалось, что постепенное привыкан ...

Передвижение воды по растению
Вода, поглощенная клетками корня, под влиянием разности водных потенциалов, которые возникают благодаря транспирации, а также силе корневого давления, передвигается до проводящих путей ксилемы. Согласно современным представлениям, вода в ...

Свойства и роль в биохимических процессах аминокислот, входящих в состав белковых молекул
Аминокислоты – это класс органических соединений, содержащих одновременно карбоксильные и аминогруппы. Обычно аминокислоты растворимы в воде и нерастворимы в органических растворителя. В нейтральных водных растворах аминокислоты существую ...